Ukrainian
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Life 2020-Jun

Representational Difference Analysis of Transcripts Involved in Jervine Biosynthesis

Тільки зареєстровані користувачі можуть перекладати статті
Увійти Зареєструватися
Посилання зберігається в буфері обміну
Magdalena Szeliga
Joanna Ciura
Mirosław Tyrka

Ключові слова

Анотація

Veratrum-type steroidal alkaloids (VSA) are the major bioactive ingredients that strongly determine the pharmacological activities of Veratrum nigrum. Biosynthesis of VSA at the molecular and genetic levels is not well understood. Next-generation sequencing of representational difference analysis (RDA) products after elicitation and precursor feeding was applied to identify candidate genes involved in VSA biosynthesis. A total of 12,048 contigs with a median length of 280 bases were received in three RDA libraries obtained after application of methyl jasmonate, squalene and cholesterol. The comparative analysis of annotated sequences was effective in identifying candidate genes. GABAT2 transaminase and hydroxylases active at C-22, C-26, C-11, and C-16 positions in late stages of jervine biosynthesis were selected. Moreover, genes coding pyrroline-5-carboxylate reductase and enzymes from the short-chain dehydrogenases/reductases family (SDR) associated with the reduction reactions of the VSA biosynthesis process were proposed. The data collected contribute to better understanding of jervine biosynthesis and may accelerate implementation of biotechnological methods of VSA biosynthesis.

Keywords: Next Generation Sequencing (NGS); Veratrum nigrum L.; black false hellebore; cDNA RDA; gene annotation.

Приєднуйтесь до нашої
сторінки у Facebook

Найповніша база даних про лікарські трави, підкріплена наукою

  • Працює 55 мовами
  • Лікування травами за підтримки науки
  • Розпізнавання трав за зображенням
  • Інтерактивна GPS-карта - позначайте трави на місці (скоро)
  • Читайте наукові публікації, пов’язані з вашим пошуком
  • Шукайте лікарські трави за їх впливом
  • Організуйте свої інтереси та будьте в курсі новинних досліджень, клінічних випробувань та патентів

Введіть симптом або хворобу та прочитайте про трави, які можуть допомогти, наберіть траву та ознайомтесь із захворюваннями та симптомами, проти яких вона застосовується.
* Вся інформація базується на опублікованих наукових дослідженнях

Google Play badgeApp Store badge